1981年7月，在中共安庆市委的领导下，在九三学社安徽省合肥分社的关心下，安庆市的4名九三学社社员成立了九三学社安徽合肥分社安庆市直属小组，由张智珊教授任组长，胡庆禧任秘书，由此拉开了安庆市九三学社组织发展的序幕。1984年10月，九三学社安庆市委员会筹备小组成立，由陈继东任组长；1985年9月，九三学社安庆市第一届委员会正式成立。截至2021年12月底，下辖3个区委会、9个支社、8个专门委员会。全社共有社员243人，具有大学以上学历208人，占比85.6%；具有高级职称166人，占比68.3%；界别分布中，科学技术以及与之相关的高等教育、医药卫生界别占比达86%。

九三学社安庆市委成立以来，在九三学社安徽省委和中共安庆市委的坚强领导下，在中共安庆市委统战部的指导帮助下，紧紧围绕国家、省市发展大局，努力开拓创新，着力加强新时代中国特色社会主义参政党建设，主动适应新常态，全面加强自身建设，认真履行参政党职能，为安庆的经济建设和社会发展作出了应有的贡献。

九三学社安庆市委历任主委为陈继东、陈培尧、章甲、胡万宝，现任主委程玉梅。九三学社安庆市委主办有社内刊物《安庆九三》，建有九三学社安庆市委网站和公众号。